本院是清华大学与南京政府联合创建的以信息产业技术为依托；以创新技术为发展的高科技信息技术研究院。“南京软件谷移动互联网研究院”，将努力打造成移动互联大数据研发平台、科技成果转化平台、专业人才培训平台和招才引智、招商引资品牌平台五位一体的、开放的、国际知名、国内一流的高层次公共科研服务平台。
本院下设不同方向的研究中心，针对研究方向招收专业人才，并将成为南京市与清华大学在移动互联网方向的人才、技术、信息方面重要的沟通管道。